MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 59345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021825	AAG	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880189
2	NC_021825	GTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880189
3	NC_021825	GTT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880189
4	NC_021825	T	6	6	1556	1561	0 %	100 %	0 %	0 %	525880189
5	NC_021825	ACA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880189
6	NC_021825	GTA	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880189
7	NC_021825	GC	3	6	1676	1681	0 %	0 %	50 %	50 %	525880189
8	NC_021825	GATTT	2	10	1684	1693	20 %	60 %	20 %	0 %	525880189
9	NC_021825	GC	3	6	1717	1722	0 %	0 %	50 %	50 %	525880189
10	NC_021825	CAT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880189
11	NC_021825	CAC	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880189
12	NC_021825	AGC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880189
13	NC_021825	AAC	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880189
14	NC_021825	CTT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880189
15	NC_021825	T	7	7	2107	2113	0 %	100 %	0 %	0 %	525880189
16	NC_021825	ATT	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880189
17	NC_021825	ATC	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
18	NC_021825	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	525880190
19	NC_021825	CCGC	2	8	2273	2280	0 %	0 %	25 %	75 %	525880190
20	NC_021825	ATC	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
21	NC_021825	TACT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	0 %	25 %	525880190
22	NC_021825	T	7	7	2412	2418	0 %	100 %	0 %	0 %	525880190
23	NC_021825	TTGC	2	8	2421	2428	0 %	50 %	25 %	25 %	525880190
24	NC_021825	ACT	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
25	NC_021825	TGT	3	9	2585	2593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880191
26	NC_021825	CAT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880191
27	NC_021825	TGT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880191
28	NC_021825	TAA	2	6	2649	2654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
29	NC_021825	TTC	2	6	2665	2670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880191
30	NC_021825	CTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880191
31	NC_021825	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
32	NC_021825	CAA	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880191
33	NC_021825	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
34	NC_021825	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880192
35	NC_021825	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880192
36	NC_021825	T	6	6	2966	2971	0 %	100 %	0 %	0 %	525880192
37	NC_021825	TTA	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880192
38	NC_021825	TAG	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880192
39	NC_021825	A	6	6	3017	3022	100 %	0 %	0 %	0 %	525880192
40	NC_021825	ATA	2	6	3081	3086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880193
41	NC_021825	TTG	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880193
42	NC_021825	TCT	2	6	3120	3125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880193
43	NC_021825	TGG	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880193
44	NC_021825	TGCT	2	8	3210	3217	0 %	50 %	25 %	25 %	525880193
45	NC_021825	TGG	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880193
46	NC_021825	GT	3	6	3291	3296	0 %	50 %	50 %	0 %	525880193
47	NC_021825	TCCG	2	8	3298	3305	0 %	25 %	25 %	50 %	525880193
48	NC_021825	TCT	2	6	3309	3314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880193
49	NC_021825	TCA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880193
50	NC_021825	TTA	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880193
51	NC_021825	TGT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880193
52	NC_021825	TAAA	2	8	3414	3421	75 %	25 %	0 %	0 %	525880194
53	NC_021825	AT	4	8	3495	3502	50 %	50 %	0 %	0 %	525880194
54	NC_021825	TGC	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880194
55	NC_021825	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880194
56	NC_021825	A	6	6	3574	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	525880194
57	NC_021825	CAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880194
58	NC_021825	TTC	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880194
59	NC_021825	A	7	7	3753	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	525880194
60	NC_021825	GTT	2	6	3808	3813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880194
61	NC_021825	T	6	6	3948	3953	0 %	100 %	0 %	0 %	525880194
62	NC_021825	ATC	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880194
63	NC_021825	CTAT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	525880194
64	NC_021825	T	7	7	4074	4080	0 %	100 %	0 %	0 %	525880194
65	NC_021825	TA	3	6	4097	4102	50 %	50 %	0 %	0 %	525880194
66	NC_021825	TA	4	8	4131	4138	50 %	50 %	0 %	0 %	525880194
67	NC_021825	GAT	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880194
68	NC_021825	CT	3	6	4243	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	525880194
69	NC_021825	CAG	3	9	4289	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880194
70	NC_021825	TTATCT	2	12	4318	4329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525880194
71	NC_021825	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	525880194
72	NC_021825	TCT	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880194
73	NC_021825	AAC	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880195
74	NC_021825	CGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880195
75	NC_021825	CTGA	2	8	4540	4547	25 %	25 %	25 %	25 %	525880195
76	NC_021825	GCGAA	2	10	4636	4645	40 %	0 %	40 %	20 %	525880195
77	NC_021825	AAC	2	6	4648	4653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880195
78	NC_021825	CAG	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
79	NC_021825	CAG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
80	NC_021825	AGT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880195
81	NC_021825	GTT	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
82	NC_021825	TCT	2	6	4806	4811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880195
83	NC_021825	AT	3	6	4821	4826	50 %	50 %	0 %	0 %	525880195
84	NC_021825	TGC	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
85	NC_021825	TTG	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
86	NC_021825	CGG	2	6	4940	4945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880195
87	NC_021825	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
88	NC_021825	TTTA	2	8	5033	5040	25 %	75 %	0 %	0 %	525880195
89	NC_021825	TCG	2	6	5082	5087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
90	NC_021825	ATC	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880195
91	NC_021825	TGC	2	6	5119	5124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
92	NC_021825	TTA	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880195
93	NC_021825	TGT	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
94	NC_021825	AGA	2	6	5285	5290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880195
95	NC_021825	CTA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880195
96	NC_021825	ATTC	2	8	5317	5324	25 %	50 %	0 %	25 %	525880195
97	NC_021825	CCG	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880195
98	NC_021825	TAA	2	6	5335	5340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880195
99	NC_021825	T	7	7	5468	5474	0 %	100 %	0 %	0 %	525880195
100	NC_021825	ATG	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
101	NC_021825	GTTT	2	8	5572	5579	0 %	75 %	25 %	0 %	525877703
102	NC_021825	AAAC	2	8	5641	5648	75 %	0 %	0 %	25 %	525877703
103	NC_021825	AGT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
104	NC_021825	TG	3	6	5933	5938	0 %	50 %	50 %	0 %	525877703
105	NC_021825	TTG	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877703
106	NC_021825	CAG	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877703
107	NC_021825	TTG	2	6	6006	6011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877703
108	NC_021825	TAACA	2	10	6017	6026	60 %	20 %	0 %	20 %	525877703
109	NC_021825	TCT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877703
110	NC_021825	CTT	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877703
111	NC_021825	AAAT	2	8	6234	6241	75 %	25 %	0 %	0 %	525877703
112	NC_021825	GCT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877703
113	NC_021825	AAC	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877703
114	NC_021825	TAA	2	6	6347	6352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877703
115	NC_021825	ATT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877703
116	NC_021825	GTA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
117	NC_021825	TA	3	6	6525	6530	50 %	50 %	0 %	0 %	525880196
118	NC_021825	GTT	2	6	6548	6553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880196
119	NC_021825	TCGATT	2	12	6572	6583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880196
120	NC_021825	CCG	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880196
121	NC_021825	ATA	2	6	6597	6602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880196
122	NC_021825	TG	3	6	6847	6852	0 %	50 %	50 %	0 %	525880196
123	NC_021825	CTTATA	2	12	6853	6864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525880196
124	NC_021825	T	6	6	7039	7044	0 %	100 %	0 %	0 %	525880196
125	NC_021825	GTA	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880196
126	NC_021825	AAT	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880196
127	NC_021825	TCA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880196
128	NC_021825	ATT	2	6	7231	7236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880196
129	NC_021825	ACTT	2	8	7258	7265	25 %	50 %	0 %	25 %	525880196
130	NC_021825	T	7	7	7335	7341	0 %	100 %	0 %	0 %	525880196
131	NC_021825	CTATT	2	10	7388	7397	20 %	60 %	0 %	20 %	525880197
132	NC_021825	TAT	2	6	7505	7510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
133	NC_021825	AAT	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
134	NC_021825	TAC	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
135	NC_021825	TTA	2	6	7648	7653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
136	NC_021825	GAAT	2	8	7747	7754	50 %	25 %	25 %	0 %	525880197
137	NC_021825	GTT	2	6	7817	7822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
138	NC_021825	TCT	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
139	NC_021825	CGC	2	6	7857	7862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880197
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141	NC_021825	GCT	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
142	NC_021825	TTGAT	2	10	7924	7933	20 %	60 %	20 %	0 %	525880197
143	NC_021825	ATTG	2	8	7944	7951	25 %	50 %	25 %	0 %	525880197
144	NC_021825	T	6	6	8055	8060	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
145	NC_021825	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
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147	NC_021825	ACT	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
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149	NC_021825	TTGT	3	12	8299	8310	0 %	75 %	25 %	0 %	525880197
150	NC_021825	GTA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880197
151	NC_021825	T	6	6	8436	8441	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
152	NC_021825	CAA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880197
153	NC_021825	ATT	2	6	8478	8483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
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156	NC_021825	T	7	7	8565	8571	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
157	NC_021825	TTA	2	6	8617	8622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
158	NC_021825	CTG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
159	NC_021825	TTC	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
160	NC_021825	CTG	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
161	NC_021825	T	6	6	8863	8868	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
162	NC_021825	TTA	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
163	NC_021825	TGT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
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165	NC_021825	TAT	2	6	9245	9250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
166	NC_021825	TCG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
167	NC_021825	ATA	2	6	9373	9378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
168	NC_021825	CATT	2	8	9380	9387	25 %	50 %	0 %	25 %	525880197
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173	NC_021825	T	7	7	9543	9549	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
174	NC_021825	T	6	6	9566	9571	0 %	100 %	0 %	0 %	525880197
175	NC_021825	TTTTG	2	10	9658	9667	0 %	80 %	20 %	0 %	525880197
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250	NC_021825	TTC	2	6	13102	13107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880198
251	NC_021825	ATC	2	6	13153	13158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880198
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255	NC_021825	T	6	6	13338	13343	0 %	100 %	0 %	0 %	525880199
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259	NC_021825	TAT	2	6	13577	13582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880199
260	NC_021825	TGT	2	6	13586	13591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880199
261	NC_021825	ATTT	2	8	13592	13599	25 %	75 %	0 %	0 %	525880199
262	NC_021825	TCT	2	6	13613	13618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880199
263	NC_021825	GCG	2	6	13647	13652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880199
264	NC_021825	TCA	2	6	13657	13662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880199
265	NC_021825	TTC	2	6	13713	13718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880199
266	NC_021825	ATTA	2	8	13728	13735	50 %	50 %	0 %	0 %	525880199
267	NC_021825	CTG	2	6	13809	13814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877704
268	NC_021825	TAC	2	6	13831	13836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877704
269	NC_021825	CCACT	2	10	13905	13914	20 %	20 %	0 %	60 %	525877704
270	NC_021825	CTTTTG	2	12	13923	13934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525877704
271	NC_021825	GAA	2	6	13943	13948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525877704
272	NC_021825	CTT	2	6	13959	13964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877704
273	NC_021825	CTC	2	6	14062	14067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525877705
274	NC_021825	CCA	2	6	14142	14147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525877705
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276	NC_021825	T	6	6	14335	14340	0 %	100 %	0 %	0 %	525877705
277	NC_021825	CCGTCA	2	12	14346	14357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525877705
278	NC_021825	CAA	2	6	14452	14457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877705
279	NC_021825	ATTTTT	2	12	14502	14513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525877705
280	NC_021825	AT	3	6	14525	14530	50 %	50 %	0 %	0 %	525880200
281	NC_021825	CAT	2	6	14568	14573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880200
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284	NC_021825	CT	3	6	14651	14656	0 %	50 %	0 %	50 %	525880200
285	NC_021825	AGC	2	6	14677	14682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880200
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289	NC_021825	A	6	6	14897	14902	100 %	0 %	0 %	0 %	525880200
290	NC_021825	CTC	2	6	14922	14927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880201
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295	NC_021825	TTGAT	2	10	15105	15114	20 %	60 %	20 %	0 %	525880201
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298	NC_021825	T	7	7	15198	15204	0 %	100 %	0 %	0 %	525880201
299	NC_021825	ACC	2	6	15255	15260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880202
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302	NC_021825	TCT	3	9	15522	15530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880202
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380	NC_021825	ATC	2	6	20045	20050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877707
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383	NC_021825	T	6	6	20252	20257	0 %	100 %	0 %	0 %	525877707
384	NC_021825	ATT	2	6	20325	20330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877707
385	NC_021825	CCT	2	6	20350	20355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525877708
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387	NC_021825	TGA	2	6	20431	20436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877708
388	NC_021825	TTC	2	6	20489	20494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877708
389	NC_021825	ATA	2	6	20525	20530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877708
390	NC_021825	T	6	6	20579	20584	0 %	100 %	0 %	0 %	525877708
391	NC_021825	GTA	2	6	20624	20629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877708
392	NC_021825	AAT	2	6	20731	20736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877708
393	NC_021825	ACT	2	6	20754	20759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877708
394	NC_021825	TGT	2	6	20834	20839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877708
395	NC_021825	TAA	2	6	20985	20990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877708
396	NC_021825	TCA	2	6	21054	21059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877708
397	NC_021825	AGT	2	6	21068	21073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877708
398	NC_021825	ATC	2	6	21089	21094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877708
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401	NC_021825	TCT	2	6	21213	21218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877708
402	NC_021825	GTCA	2	8	21230	21237	25 %	25 %	25 %	25 %	525877708
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425	NC_021825	T	6	6	22172	22177	0 %	100 %	0 %	0 %	525877709
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461	NC_021825	TTCTG	2	10	24115	24124	0 %	60 %	20 %	20 %	525880209
462	NC_021825	GT	3	6	24132	24137	0 %	50 %	50 %	0 %	525880209
463	NC_021825	ACT	2	6	24146	24151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880209
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491	NC_021825	TA	3	6	25668	25673	50 %	50 %	0 %	0 %	525880212
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499	NC_021825	ATT	2	6	26106	26111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880213
500	NC_021825	TG	3	6	26245	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	525880214

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